Sejarah awal mula berdirinya lembaga pendidikan Yayasan Amir Ash-Sdhiddiiqi Kami menyadari bahwa anak pada usia sekolah sangat rentan dengan pengaruh lingkungan yang saat ini kurang kondusif untuk pertumbuhan generasi masa depan, seperti banyaknya anak-anak yang menghabiskan waktu dengan gadget, menonton TV, bermain game online hingga pergaulan bebbas dan pemakaian obat-obatan terlarang. Maka Yayasan Ash-Shiddiiqi telah membuka SMP-IT dengan konsep Boarding School (sekolah berasrama) pada tahun 2014. Dan saat ini, SMP IT Ash-Shiddiiqi memiliki 14 rombongan belajar, sedangkan SMA IT Ash-Shiddiiqi memiliki 2 rombongan belajar. SMP- SMA IT Ash-Shiddiiqi membuka PPDB (Penerimaan Peserta Didik Baru) Tahun Pendidikan 2018/2019 dengan SMP menerima 6 kelas, SMA 2 kelas masing-masing kelas berisi 30 siswa/i.

Bedasarkan keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam Nomor 1793 Tahun 2021 Sekolah Yayasan Amir Ash-Shiddiiqi telah resmi menjadi �Pondok Pesantren Ash-Shiddiiqi�� di tetapkan di Jakarta  Pada tanggal 6 Agustus 2021, beralamat di Jl. Jambi � Ma. Bulian KM 36 RT. 03 Kel. Jembatan Mas Kec. Pemayung Kab. Batanghari Propinsi Jambi dengan Nomor Statistik 510015040026.